Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF01

PNISR, Arginine/serine-rich protein PNISR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISRQ8TF01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
PNISRQ8TF01 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PNISRQ8TF01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PNISRQ8TF01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PNISRQ8TF01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PNISRQ8TF01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PNISRQ8TF01 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PNISRQ8TF01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PNISRQ8TF01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PNISRQ8TF01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PNISRQ8TF01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PNISRQ8TF01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PNISRQ8TF01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PNISRQ8TF01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PNISRQ8TF01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PNISRQ8TF01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PNISRQ8TF01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PNISRQ8TF01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms