Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEM1

NUP210, Nuclear pore membrane glycoprotein 210, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP210Q8TEM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP210Q8TEM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP210Q8TEM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP210Q8TEM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP210Q8TEM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP210Q8TEM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP210Q8TEM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP210Q8TEM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP210Q8TEM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms