Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TMC1Q8TDI8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TMC1Q8TDI8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TMC1Q8TDI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TMC1Q8TDI8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TMC1Q8TDI8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TMC1Q8TDI8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TMC1Q8TDI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TMC1Q8TDI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TMC1Q8TDI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TMC1Q8TDI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TMC1Q8TDI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TMC1Q8TDI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TMC1Q8TDI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TMC1Q8TDI8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TMC1Q8TDI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms