Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y2Q8TD47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4Y2Q8TD47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS4Y2Q8TD47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4Y2Q8TD47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y2Q8TD47 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y2Q8TD47 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y2Q8TD47 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms