Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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