Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF439Q8NDP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF439Q8NDP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF439Q8NDP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF439Q8NDP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF439Q8NDP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF439Q8NDP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms