Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C3orf20Q8ND61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C3orf20Q8ND61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C3orf20Q8ND61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C3orf20Q8ND61 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C3orf20Q8ND61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C3orf20Q8ND61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C3orf20Q8ND61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C3orf20Q8ND61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C3orf20Q8ND61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C3orf20Q8ND61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C3orf20Q8ND61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C3orf20Q8ND61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C3orf20Q8ND61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C3orf20Q8ND61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C3orf20Q8ND61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms