Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APCDD1LQ8NCL9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APCDD1LQ8NCL9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APCDD1LQ8NCL9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APCDD1LQ8NCL9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APCDD1LQ8NCL9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1LQ8NCL9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APCDD1LQ8NCL9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms