Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT2

TDRD5, Tudor domain-containing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD5Q8NAT2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TDRD5Q8NAT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TDRD5Q8NAT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TDRD5Q8NAT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TDRD5Q8NAT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TDRD5Q8NAT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TDRD5Q8NAT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD5Q8NAT2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TDRD5Q8NAT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TDRD5Q8NAT2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TDRD5Q8NAT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TDRD5Q8NAT2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD5Q8NAT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms