Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC29Q8NA56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC29Q8NA56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC29Q8NA56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC29Q8NA56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC29Q8NA56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC29Q8NA56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC29Q8NA56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms