Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf29Q8N999 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf29Q8N999 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf29Q8N999 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C12orf29Q8N999 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C12orf29Q8N999 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf29Q8N999 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf29Q8N999 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf29Q8N999 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C12orf29Q8N999 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf29Q8N999 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf29Q8N999 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf29Q8N999 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf29Q8N999 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf29Q8N999 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms