Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71E2Q8N5Q1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E2Q8N5Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM71E2Q8N5Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71E2Q8N5Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E2Q8N5Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms