Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM71E2Q8N5Q1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM71E2Q8N5Q1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM71E2Q8N5Q1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71E2Q8N5Q1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71E2Q8N5Q1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM71E2Q8N5Q1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM71E2Q8N5Q1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM71E2Q8N5Q1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM71E2Q8N5Q1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM71E2Q8N5Q1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM71E2Q8N5Q1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM71E2Q8N5Q1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM71E2Q8N5Q1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM71E2Q8N5Q1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM71E2Q8N5Q1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM71E2Q8N5Q1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM71E2Q8N5Q1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71E2Q8N5Q1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71E2Q8N5Q1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71E2Q8N5Q1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71E2Q8N5Q1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71E2Q8N5Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM71E2Q8N5Q1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM71E2Q8N5Q1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71E2Q8N5Q1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71E2Q8N5Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM71E2Q8N5Q1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71E2Q8N5Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71E2Q8N5Q1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71E2Q8N5Q1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71E2Q8N5Q1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71E2Q8N5Q1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71E2Q8N5Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71E2Q8N5Q1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71E2Q8N5Q1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71E2Q8N5Q1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71E2Q8N5Q1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71E2Q8N5Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71E2Q8N5Q1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71E2Q8N5Q1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71E2Q8N5Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71E2Q8N5Q1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71E2Q8N5Q1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71E2Q8N5Q1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71E2Q8N5Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71E2Q8N5Q1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM71E2Q8N5Q1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71E2Q8N5Q1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71E2Q8N5Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM71E2Q8N5Q1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM71E2Q8N5Q1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71E2Q8N5Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71E2Q8N5Q1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71E2Q8N5Q1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71E2Q8N5Q1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71E2Q8N5Q1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71E2Q8N5Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71E2Q8N5Q1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71E2Q8N5Q1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71E2Q8N5Q1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71E2Q8N5Q1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71E2Q8N5Q1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71E2Q8N5Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71E2Q8N5Q1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71E2Q8N5Q1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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