Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNKDQ8N490 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNKDQ8N490 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNKDQ8N490 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNKDQ8N490 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNKDQ8N490 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNKDQ8N490 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms