Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF28Q8N1W1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF28Q8N1W1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ARHGEF28Q8N1W1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARHGEF28Q8N1W1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF28Q8N1W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF28Q8N1W1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF28Q8N1W1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARHGEF28Q8N1W1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF28Q8N1W1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF28Q8N1W1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
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