Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLAQ8IXN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLAQ8IXN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLAQ8IXN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIMKLAQ8IXN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIMKLAQ8IXN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIMKLAQ8IXN7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms