Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIMKLAQ8IXN7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIMKLAQ8IXN7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RIMKLAQ8IXN7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RIMKLAQ8IXN7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RIMKLAQ8IXN7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RIMKLAQ8IXN7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RIMKLAQ8IXN7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RIMKLAQ8IXN7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIMKLAQ8IXN7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RIMKLAQ8IXN7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RIMKLAQ8IXN7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RIMKLAQ8IXN7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RIMKLAQ8IXN7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RIMKLAQ8IXN7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RIMKLAQ8IXN7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIMKLAQ8IXN7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RIMKLAQ8IXN7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RIMKLAQ8IXN7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RIMKLAQ8IXN7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIMKLAQ8IXN7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIMKLAQ8IXN7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIMKLAQ8IXN7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIMKLAQ8IXN7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIMKLAQ8IXN7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIMKLAQ8IXN7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIMKLAQ8IXN7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIMKLAQ8IXN7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIMKLAQ8IXN7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIMKLAQ8IXN7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIMKLAQ8IXN7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIMKLAQ8IXN7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIMKLAQ8IXN7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIMKLAQ8IXN7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIMKLAQ8IXN7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMKLAQ8IXN7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMKLAQ8IXN7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMKLAQ8IXN7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIMKLAQ8IXN7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIMKLAQ8IXN7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIMKLAQ8IXN7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIMKLAQ8IXN7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIMKLAQ8IXN7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIMKLAQ8IXN7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIMKLAQ8IXN7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIMKLAQ8IXN7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIMKLAQ8IXN7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIMKLAQ8IXN7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIMKLAQ8IXN7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMKLAQ8IXN7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMKLAQ8IXN7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIMKLAQ8IXN7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMKLAQ8IXN7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMKLAQ8IXN7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIMKLAQ8IXN7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIMKLAQ8IXN7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIMKLAQ8IXN7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIMKLAQ8IXN7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIMKLAQ8IXN7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIMKLAQ8IXN7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RIMKLAQ8IXN7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIMKLAQ8IXN7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIMKLAQ8IXN7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMKLAQ8IXN7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMKLAQ8IXN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMKLAQ8IXN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMKLAQ8IXN7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMKLAQ8IXN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMKLAQ8IXN7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMKLAQ8IXN7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMKLAQ8IXN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIMKLAQ8IXN7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMKLAQ8IXN7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMKLAQ8IXN7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMKLAQ8IXN7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMKLAQ8IXN7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMKLAQ8IXN7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMKLAQ8IXN7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMKLAQ8IXN7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMKLAQ8IXN7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMKLAQ8IXN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMKLAQ8IXN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMKLAQ8IXN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMKLAQ8IXN7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RIMKLAQ8IXN7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms