Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM42Q8IWZ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM42Q8IWZ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM42Q8IWZ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM42Q8IWZ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM42Q8IWZ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM42Q8IWZ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM42Q8IWZ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM42Q8IWZ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM42Q8IWZ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms