Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN4Q8IWV2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN4Q8IWV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN4Q8IWV2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN4Q8IWV2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN4Q8IWV2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN4Q8IWV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN4Q8IWV2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN4Q8IWV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms