Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB43Q86YS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB43Q86YS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB43Q86YS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB43Q86YS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB43Q86YS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB43Q86YS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB43Q86YS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB43Q86YS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB43Q86YS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB43Q86YS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms