Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH9Q86YJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH9Q86YJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH9Q86YJ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCH9Q86YJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCH9Q86YJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH9Q86YJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH9Q86YJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH9Q86YJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms