Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS37DQ86XT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VPS37DQ86XT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS37DQ86XT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS37DQ86XT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS37DQ86XT2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
VPS37DQ86XT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
VPS37DQ86XT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS37DQ86XT2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VPS37DQ86XT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS37DQ86XT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS37DQ86XT2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms