Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV6

TMEM173, Stimulator of interferon genes protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM173Q86WV6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM173Q86WV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM173Q86WV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM173Q86WV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM173Q86WV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM173Q86WV6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM173Q86WV6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM173Q86WV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM173Q86WV6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM173Q86WV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM173Q86WV6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms