Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms