Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1LQ7Z5L2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1LQ7Z5L2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1LQ7Z5L2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
R3HCC1LQ7Z5L2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms