Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC3Q7RTR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC3Q7RTR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC3Q7RTR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC3Q7RTR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC3Q7RTR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC3Q7RTR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC3Q7RTR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC3Q7RTR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms