Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZ85

SUPT6H, Transcription elongation factor SPT6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT6HQ7KZ85 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT6HQ7KZ85 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT6HQ7KZ85 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT6HQ7KZ85 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT6HQ7KZ85 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
SUPT6HQ7KZ85 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT6HQ7KZ85 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT6HQ7KZ85 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT6HQ7KZ85 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SUPT6HQ7KZ85 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT6HQ7KZ85 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT6HQ7KZ85 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SUPT6HQ7KZ85 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SUPT6HQ7KZ85 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SUPT6HQ7KZ85 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SUPT6HQ7KZ85 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SUPT6HQ7KZ85 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SUPT6HQ7KZ85 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SUPT6HQ7KZ85 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms