Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHSY3Q70JA7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHSY3Q70JA7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHSY3Q70JA7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHSY3Q70JA7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHSY3Q70JA7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHSY3Q70JA7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY3Q70JA7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHSY3Q70JA7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms