Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PACS1Q6VY07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACS1Q6VY07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACS1Q6VY07 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PACS1Q6VY07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PACS1Q6VY07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PACS1Q6VY07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PACS1Q6VY07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PACS1Q6VY07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PACS1Q6VY07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PACS1Q6VY07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PACS1Q6VY07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS1Q6VY07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS1Q6VY07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PACS1Q6VY07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms