Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEACAM20Q6UY09 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEACAM20Q6UY09 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEACAM20Q6UY09 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEACAM20Q6UY09 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEACAM20Q6UY09 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEACAM20Q6UY09 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CEACAM20Q6UY09 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms