Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP12Q6UXS9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP12Q6UXS9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP12Q6UXS9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP12Q6UXS9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP12Q6UXS9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP12Q6UXS9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP12Q6UXS9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms