Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATAD2Q6PL18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ATAD2Q6PL18 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATAD2Q6PL18 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ATAD2Q6PL18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATAD2Q6PL18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATAD2Q6PL18 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATAD2Q6PL18 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATAD2Q6PL18 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATAD2Q6PL18 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATAD2Q6PL18 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms