Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms