Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC144NLQ6NUI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC144NLQ6NUI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms