Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRAMD4Q6IC98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRAMD4Q6IC98 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRAMD4Q6IC98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD4Q6IC98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRAMD4Q6IC98 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRAMD4Q6IC98 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms