Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCAPH2Q6IBW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCAPH2Q6IBW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NCAPH2Q6IBW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPH2Q6IBW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPH2Q6IBW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCAPH2Q6IBW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCAPH2Q6IBW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPH2Q6IBW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPH2Q6IBW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPH2Q6IBW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPH2Q6IBW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPH2Q6IBW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPH2Q6IBW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCAPH2Q6IBW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms