Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM68Q6AZZ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM68Q6AZZ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM68Q6AZZ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM68Q6AZZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM68Q6AZZ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM68Q6AZZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM68Q6AZZ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms