Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GARNL3Q5VVW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARNL3Q5VVW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARNL3Q5VVW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GARNL3Q5VVW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GARNL3Q5VVW2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARNL3Q5VVW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARNL3Q5VVW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms