Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YOD1Q5VVQ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
YOD1Q5VVQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YOD1Q5VVQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YOD1Q5VVQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YOD1Q5VVQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YOD1Q5VVQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YOD1Q5VVQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YOD1Q5VVQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YOD1Q5VVQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YOD1Q5VVQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YOD1Q5VVQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms