Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC38Q5VT99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC38Q5VT99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC38Q5VT99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC38Q5VT99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC38Q5VT99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC38Q5VT99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC38Q5VT99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC38Q5VT99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC38Q5VT99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC38Q5VT99 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms