Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RPRD2Q5VT52 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RPRD2Q5VT52 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RPRD2Q5VT52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RPRD2Q5VT52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RPRD2Q5VT52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RPRD2Q5VT52 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RPRD2Q5VT52 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
RPRD2Q5VT52 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RPRD2Q5VT52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RPRD2Q5VT52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RPRD2Q5VT52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms