Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF648Q5T619 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF648Q5T619 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF648Q5T619 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF648Q5T619 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF648Q5T619 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF648Q5T619 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms