Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZI1

LDLRAD2, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD2Q5SZI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD2Q5SZI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD2Q5SZI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD2Q5SZI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD2Q5SZI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD2Q5SZI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD2Q5SZI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms