Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNFT1Q5M7Z0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNFT1Q5M7Z0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNFT1Q5M7Z0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNFT1Q5M7Z0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNFT1Q5M7Z0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNFT1Q5M7Z0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNFT1Q5M7Z0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNFT1Q5M7Z0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms