Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PITRM1Q5JRX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITRM1Q5JRX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITRM1Q5JRX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PITRM1Q5JRX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITRM1Q5JRX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PITRM1Q5JRX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITRM1Q5JRX3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms