Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01556Q5JQF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC01556Q5JQF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01556Q5JQF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01556Q5JQF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01556Q5JQF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01556Q5JQF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01556Q5JQF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms