Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01559Q495D7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC01559Q495D7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01559Q495D7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01559Q495D7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01559Q495D7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC01559Q495D7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC01559Q495D7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC01559Q495D7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC01559Q495D7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms