Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ME3Q16798 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ME3Q16798 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ME3Q16798 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ME3Q16798 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ME3Q16798 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ME3Q16798 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ME3Q16798 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ME3Q16798 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ME3Q16798 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ME3Q16798 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ME3Q16798 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ME3Q16798 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ME3Q16798 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ME3Q16798 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ME3Q16798 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ME3Q16798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ME3Q16798 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ME3Q16798 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ME3Q16798 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ME3Q16798 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ME3Q16798 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ME3Q16798 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ME3Q16798 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ME3Q16798 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ME3Q16798 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ME3Q16798 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ME3Q16798 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ME3Q16798 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ME3Q16798 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ME3Q16798 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ME3Q16798 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ME3Q16798 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ME3Q16798 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ME3Q16798 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ME3Q16798 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ME3Q16798 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ME3Q16798 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ME3Q16798 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ME3Q16798 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ME3Q16798 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ME3Q16798 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ME3Q16798 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ME3Q16798 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ME3Q16798 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ME3Q16798 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ME3Q16798 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ME3Q16798 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ME3Q16798 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ME3Q16798 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ME3Q16798 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ME3Q16798 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ME3Q16798 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ME3Q16798 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ME3Q16798 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ME3Q16798 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ME3Q16798 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ME3Q16798 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ME3Q16798 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ME3Q16798 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ME3Q16798 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ME3Q16798 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ME3Q16798 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ME3Q16798 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ME3Q16798 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ME3Q16798 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ME3Q16798 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ME3Q16798 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ME3Q16798 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ME3Q16798 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ME3Q16798 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ME3Q16798 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ME3Q16798 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ME3Q16798 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ME3Q16798 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ME3Q16798 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ME3Q16798 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ME3Q16798 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ME3Q16798 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ME3Q16798 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ME3Q16798 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ME3Q16798 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ME3Q16798 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ME3Q16798 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ME3Q16798 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ME3Q16798 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ME3Q16798 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ME3Q16798 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ME3Q16798 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ME3Q16798 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ME3Q16798 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ME3Q16798 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ME3Q16798 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ME3Q16798 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ME3Q16798 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ME3Q16798 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ME3Q16798 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ME3Q16798 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ME3Q16798 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ME3Q16798 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
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