Protein–RNA interactions for Protein: Q16537

PPP2R5E, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R5EQ16537 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP2R5EQ16537 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R5EQ16537 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R5EQ16537 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPP2R5EQ16537 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R5EQ16537 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP2R5EQ16537 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP2R5EQ16537 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP2R5EQ16537 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP2R5EQ16537 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP2R5EQ16537 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R5EQ16537 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP2R5EQ16537 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP2R5EQ16537 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R5EQ16537 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R5EQ16537 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R5EQ16537 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP2R5EQ16537 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms