Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY1Q16526 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRY1Q16526 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY1Q16526 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY1Q16526 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY1Q16526 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY1Q16526 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRY1Q16526 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRY1Q16526 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY1Q16526 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY1Q16526 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRY1Q16526 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRY1Q16526 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRY1Q16526 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRY1Q16526 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CRY1Q16526 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY1Q16526 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CRY1Q16526 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY1Q16526 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms