Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CRY1Q16526 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRY1Q16526 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CRY1Q16526 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRY1Q16526 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CRY1Q16526 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRY1Q16526 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRY1Q16526 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CRY1Q16526 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRY1Q16526 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CRY1Q16526 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CRY1Q16526 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CRY1Q16526 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRY1Q16526 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRY1Q16526 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRY1Q16526 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRY1Q16526 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CRY1Q16526 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRY1Q16526 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRY1Q16526 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CRY1Q16526 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRY1Q16526 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRY1Q16526 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CRY1Q16526 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRY1Q16526 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRY1Q16526 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRY1Q16526 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRY1Q16526 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRY1Q16526 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRY1Q16526 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRY1Q16526 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CRY1Q16526 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CRY1Q16526 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CRY1Q16526 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRY1Q16526 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CRY1Q16526 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRY1Q16526 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CRY1Q16526 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRY1Q16526 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CRY1Q16526 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRY1Q16526 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRY1Q16526 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRY1Q16526 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRY1Q16526 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRY1Q16526 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRY1Q16526 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRY1Q16526 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CRY1Q16526 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRY1Q16526 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRY1Q16526 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CRY1Q16526 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CRY1Q16526 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRY1Q16526 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRY1Q16526 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRY1Q16526 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CRY1Q16526 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRY1Q16526 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRY1Q16526 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CRY1Q16526 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRY1Q16526 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRY1Q16526 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRY1Q16526 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRY1Q16526 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRY1Q16526 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRY1Q16526 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRY1Q16526 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRY1Q16526 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRY1Q16526 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRY1Q16526 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRY1Q16526 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRY1Q16526 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRY1Q16526 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRY1Q16526 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRY1Q16526 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CRY1Q16526 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CRY1Q16526 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRY1Q16526 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRY1Q16526 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CRY1Q16526 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRY1Q16526 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CRY1Q16526 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRY1Q16526 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRY1Q16526 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRY1Q16526 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms